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分子動力分析為什么離不開分析互作儀

更新時間:2025-07-04點擊次數(shù):25

一、動力學(xué)分析的核心需求 :捕捉動態(tài)相互作用

動力學(xué)分析的本質(zhì)是研究分子、細胞或系統(tǒng)在時間維度上的行為變化,例如藥物與靶標蛋 白的結(jié)合速率、蛋白質(zhì)折疊路徑、病毒與宿主受體的識別過程等。這類研究需要實時監(jiān)測 分子間相互作用的動態(tài)參數(shù),如結(jié)合常數(shù)(Kd)、解離速率(koff)、結(jié)合速率(kon)

等,而這些參數(shù)直接決定了生物過程的效率與機制。

傳統(tǒng)實驗方法(如熒光標記、放射性同位素法)存在標記干擾、耗時長、通量低等缺陷, 難以滿足復(fù)雜動態(tài)系統(tǒng)的分析需求。而分子互作儀通過無標記、實時監(jiān)測的技術(shù)特性,成 為動力學(xué)分析的“核心工具"。例如,在藥物研發(fā)中,通過分子互作儀可精準量化抑制劑與  酶的結(jié)合動力學(xué),預(yù)測藥物在體內(nèi)的代謝半衰期。

分子互作儀的應(yīng)用(1)

二、Gator Pro BLI儀器的技術(shù)革新

Gator Pro是由小鱷生物( Gator Bio)開發(fā)的高通量生物層干涉技術(shù)(BioLayer Interferometry, BLI )儀器,其技術(shù)優(yōu)勢與動力學(xué)分析需求高度契合:

1. 無標記實時監(jiān)測

BLI技術(shù)通過檢測生物分子結(jié)合時引起的微米級懸臂梁光學(xué)干涉信號變化,無需熒光 標記或放射性同位素,避免了標記物對分子天然構(gòu)象的干擾。例如,在研究抗體-  原結(jié)合時,Gator Pro可直接監(jiān)測完整抗體(含F(xiàn)c段)與抗原的結(jié)合過程,而無需截 短或標記。

2. 高通量與自動化

Gator Pro支持96孔板高通量檢測,單次實驗可完成數(shù)百個樣本的動態(tài)分析,實驗效 率較傳統(tǒng)SPR技術(shù)提升5倍以上。其自動化的樣品加載與清洗系統(tǒng),尤其適用于篩選  小分子化合物庫(如藥物先導(dǎo)物庫)的親和力與動力學(xué)參數(shù)。

3. 寬動態(tài)范圍與高靈敏度

該儀器可檢測低至納摩爾級(nM )的結(jié)合親和力,并能區(qū)分微秒級( μs)的結(jié)合時  間差異。例如,在酶抑制動力學(xué)研究中,Gator Pro可捕捉抑制劑與靶酶從快速結(jié)合 (kon=1e6 M-1s-1)到緩慢解離(koff=1e-4 s-1)的全過程。

GatorPrime分子互作儀

三、GatorPro在動力學(xué)分析中的典型應(yīng)用

1. 藥物發(fā)現(xiàn):從靶標驗證到優(yōu)化

在新冠疫情期間,Gator Pro被用于篩選ACE2受體與病毒刺突蛋白的結(jié)合抑制劑。  通過動態(tài)分析藥物候選物的kon/koff值,科研團隊快速篩選出高選擇性化合物,縮短 3個月的實驗周期。此外,該儀器還可評估藥物分子對靶標蛋白構(gòu)象的誘導(dǎo)效應(yīng), 指導(dǎo)結(jié)構(gòu)優(yōu)化。

2. 蛋白工程:揭示折疊與變構(gòu)機制

研究團隊利用Gator Pro分析溶菌酶變構(gòu)位點的動態(tài)特性,發(fā)現(xiàn)特定小分子可誘導(dǎo)酶構(gòu)象變化,從而增強催化活性。此類數(shù)據(jù)為設(shè)計工程酶(如工業(yè)催化劑)提供了關(guān) 鍵動力學(xué)參數(shù)。

3. 免疫療法:評估免疫檢查點抑制劑

在PD-1/PD-L1抑制劑開發(fā)中,Gator Pro可量化腫瘤細胞表面PD-L1與T細胞受體的 結(jié)合動力學(xué)。實驗數(shù)據(jù)顯示,高親和力抑制劑(Kd<1nM)可顯著延長結(jié)合時間

(t1/2>24小時),從而增強抗腫瘤效果。

四、技術(shù)對比 : BLI vs. SPR vs. MST

技術(shù)

類型

核心

原理

動力學(xué)分析能力

適用場景

 

 

BLI

懸臂

梁光

學(xué)干 

實時監(jiān)測結(jié)合/解離全

過程,支持納秒級時間

分辨率

大分子復(fù)合物、

膜蛋白、細胞表

面相互作用

 

 

SPR

表面

等離

子共 

 

依賴表面固定化,難以 區(qū)分結(jié)合與擴散效應(yīng)

固定化分子(如 芯片表面蛋白)  的靜態(tài)親和力

 

MST

微量

熱泳 

通過熱變性曲線間接推

算結(jié)合參數(shù),無法直接

獲取kon/koff

熱力學(xué)穩(wěn)定性分 析、大分子復(fù)合 物解離能計算


  案例對比 :在EGFR抑制劑篩選中,SPR需固定化靶酶,可能破壞天然構(gòu)象;而Gator Pro 可直接使用溶液態(tài)酶,獲得更接近生理條件的kon值(如1e5 M-1s-1 vs. 1e4 M-1s-1),指   導(dǎo)藥物優(yōu)化。

分子互作儀參數(shù)

五、未來趨勢 :智能化與多技術(shù)融合

Gator Pro 2.0版本已集成AI算法,可自動識別結(jié)合事件并生成動力學(xué)模型。例如,通過機 器學(xué)習(xí)預(yù)測化合物對靶標蛋白的構(gòu)象鎖定效應(yīng),將實驗周期從數(shù)周縮短至48小時。此外, 該儀器正與單細胞測序平臺聯(lián)用,研究腫瘤微環(huán)境中免疫細胞與腫瘤細胞的動態(tài)互作網(wǎng)

絡(luò)。

分子互作儀通過提供“動態(tài)視角"的分子相互作用數(shù)據(jù),已成為現(xiàn)代動力學(xué)分析的重要工具。Gator Pro BLI儀器憑借其無標記、高通量、高靈敏度的技術(shù)特性,在藥物研發(fā)、蛋白工程等領(lǐng)域展現(xiàn)出其價值。隨著人工智能與多組學(xué)技術(shù)的融合,分子互作儀將進一 步推動從“靜態(tài)結(jié)構(gòu)解析"到“動態(tài)過程調(diào)控"的研究范式轉(zhuǎn)變,為生命科學(xué)突破提供核心工  具支撐。

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